Né à Vendôme en 1946, Daniel Jouanneau est ancien élève de l'Institut d'études politiques de Paris et de l'École nationale d'Administration.
Diplomate, il a servi comme attaché de presse au Caire, consul général à Salisbury puis chargé d'affaires au Zimbabwe, chef de la mission de coopération en Guinée, consul général à Québec, ambassadeur au Mozambique, au Liban, au Canada et au Pakistan. À Paris, il a suivi pendant dix ans les affaires européennes. Nommé chef du Protocole par François Mitterrand, il a été confirmé dans ses fonctions par Jacques Chirac. Il a dirigé l'Inspection générale des Affaires étrangères.
Au terme de sa carrière de diplomate (1970-2011), Daniel Jouanneau a été nommé conseiller maître en service extraordinaire à la Cour des comptes.